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基于荧光SSR标记分析濒危物种海南苏铁居群遗传多样性

文献类型: 中文期刊

作者: 符瑞侃 1 ; 戚华沙 1 ; 梁定民 1 ; 刘艳 1 ; 陈宣 1 ; 全彬 1 ; 杨珺 1 ;

作者机构: 1.海南省农业科学院热带园艺研究所

关键词: 海南苏铁;濒危植物;荧光SSR标记;遗传多样性;遗传结构

期刊名称: 中国野生植物资源

ISSN: 1006-9690

年卷期: 2025 年 44 卷 003 期

页码: 71-77

摘要: 目的:通过荧光SSR标记分析探究濒危物种海南苏铁的遗传多样性与遗传结构,以解析其濒危原因。方法:采用15对荧光标记SSR引物对9个居群150份海南苏铁样品基因组DNA进行荧光PCR扩增,并利用毛细管电泳法检测PCR产物,进而对海南苏铁各居群之间及居群内的遗传差异和遗传多样性进行分析。结果:15对引物共检测到181个等位基因,每个位点的平均等位基因数为12.07个,平均观测杂合度为0.66,平均期望杂合度为0.80,平均Shannon's多样性指数为1.91,平均多态性信息含量为0.77,表明海南苏铁居群具有较高的遗传多样性。近交系数平均值为0.03,说明海南苏铁居群杂合度较高。分子方差分析显示,遗传变异主要存在于居群内(87.65%),个体变异是海南苏铁遗传变异的主要来源;聚类分析和主坐标分析结果一致,将9个主要分布区的海南苏铁聚为2大类群:除海口单独聚为一类外,其余居群聚另外聚为一大类群,聚类依据为地理距离。结论:海南苏铁自身不存在导致濒危的遗传基础,人为的毁灭性砍伐和生境的破坏是其濒危的主要原因。

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