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MITE转座子在不同甘蓝型油菜品种中的多态性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 安素妨 1 ; 李保全 2 ; 鲁丹丹 2 ; 李高原 3 ; 侯锦娜 2 ;

作者机构： 1.河南省农业科学院作物设计中心

2.河南省农业科学院 作物设计中心

3.华中农业大学 信息学院

关键词： 微型反向重复转座因子(MITE);甘蓝型油菜;遗传多样性

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2019 年 008 期

页码： 1389-1399

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 微型反向重复转座因子(MITE)在真核生物基因组中普遍存在,其活动能够在物种内形成丰富的多态性,在基因组进化和基因调控中均发挥重要作用.该研究利用286对不同MITE家族侧翼序列筛选的特异引物,对101个中国油菜、27个加拿大油菜和29个合成油菜品系(共157个品系)的基因组DNA进行多态性研究,以明确MITE家族的插入/缺失多态性以及在不同油菜品种之间插入的遗传多样性,进而探讨他们之间的亲缘关系.结果显示:(1)286对引物中筛选出60对条带清晰重复性高的多态性引物,多态性比例21.0%;其中Stowaway-like家族和Tourist-like家族特异引物的多态性比例分别为24.6%和20.0%.(2)PCR扩增结果显示,60对多态性引物对中国、加拿大、合成油菜品系的基因组DNA分别扩增出4 029、1 044、1 087条清晰可辨的条带.(3)UPGMA聚类显示,中国油菜品种间遗传相似系数在0.59~0.95,加拿大油菜品种间遗传相似系数在0.73~0.95;合成油菜品种间遗传相似系数值在0.64~0.93.研究表明,MITE在基因组中大量随机插入,形成种内丰富的多态性,利用MITE家族引物检测不同地区的油菜种质资源的多态性,可为油菜的育种找到许多尚未被开发的遗传变异.

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