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澳洲坚果MtMADS1-like基因的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 范建新 1 ; 刘小翠 1 ; 刘荣 1 ; 康专苗 1 ; 韩树全 1 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院亚热带作物研究所

关键词: 澳洲坚果;MADS-box基因;基因克隆;表达分析

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN:

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 747-756

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: MADS-box家族基因广泛分布于植物中,在植物花发育的整个阶段起着至关重要的作用。为了探索MADS-box基因在澳洲坚果花发育过程中的分子机理,本研究以澳洲坚果‘695’为试材,采用RT-PCR及RACE技术克隆获得澳洲坚果MADS-box类转录因子基因cDNA全长,命名MtMADS1-like (GenBank登录号:MK491608)。该基因全长967 bp,开放阅读框ORF长672 bp,编码223个氨基酸,5’-UTR和3’-UTR分别为58 bp和237 bp。序列分析表明,MtMADS1-like具有保守的MADS-box结构域(MADS-MEF2-like)和半保守的K-box结构域,属于TypeⅡ型MADS-box家族基因。进化分析表明,MtMADS1-like与其他植物中MADS-box蛋白具有较高的同源性,且与猴面花(Erythranthe guttata) MADS-box家族中SVP254的同源性高达67.10%,亲缘关系最近。生物信息学分析表明MtMADS1-like属于不稳定的亲水性蛋白,不具备信号肽,属于非分泌蛋白,α-螺旋和无规则卷曲构成了二级结构的主要蛋白框架,三级结构中MADS-box结构域和K-box形成该蛋白的核心结构,并且作为转录因子定位于细胞核。qPCR分析表明,MtMADS1-like基因在不同的澳洲坚果品种中差异表达,在品种‘333’中表达量最高,在品种‘344’中表达量最低。研究结果为进一步验证MtMADS1-like的功能及阐明澳洲坚果花发育和开花调控的分子机制奠定了基础。

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