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三疣梭子蟹多态性微卫星DNA标记的筛选及评价

文献类型: 中文期刊

作者: 韩智科 1 ; 刘萍 1 ; 李健 1 ; 高保全 1 ; 陈萍 1 ;

作者机构: 1.农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 三疣梭子蟹;微卫星标记;多态性;遗传多样性

期刊名称: 渔业科学进展

ISSN: 1000-7075

年卷期: 2012 年 33 卷 01 期

页码: 74-80

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据前人FIASCO方法构建的三疣梭子蟹微卫星富集文库,对含微卫星的DNA序列设计了71对引物并对其进行了多态性筛选,筛选出21对多态的微卫星引物,对三疣梭子蟹1个野生群体的30个个体进行遗传多样性检测,同时对引物进行评价。21个位点共获得了188个等位基因,平均每个位点扩增得到8.9个等位基因。不同引物获得的等位基因数差异较大,从3~13个不等,其中Pot8、Pot37、Pot48、Pot53、Pot54、Pot66六个位点分别获得了11、12、12、11、13、11个等位基因,而Pot46仅获得了3个等位基因。等位基因的大小分布在131~312bp,基本符合引物设计时理论产物长度。21个微卫星位点的期望杂合度的范围为0.659~0.889,PIC值均高于0.5,表明它们都有很高的杂合度,均可用于三疣梭子蟹种群遗传结构分析,为三疣梭子蟹品种选育、种系评估提供更多的微卫星DNA信息。

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