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细胞核rDNA序列分析5种罗非鱼的亲缘关系

文献类型： 中文期刊

作者： 郭奕惠 1 ; 喻达辉 1 ; 黄桂菊 1 ; 符云 2 ; 叶卫 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

2.国家级广东罗非鱼良种场

关键词： 罗非鱼;细胞核rDNA;序列变异;亲缘关系

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2009 年 37 卷 08 期

页码： 3444-3447

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]探索五种罗非鱼的亲缘关系。[方法]从尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、杂交种尼奥罗非鱼、莫桑比克罗非鱼和红罗非鱼基因组中提取DNA,通过PCR扩增其ITS1基因序列及18S、5.8S部分序列并进行序列分析。[结果]扩增片段大小约700 bp,测序结果显示获得的序列包括完整的ITS1区以及18S和5.8S部分序列。序列长度变异主要在ITS1区,18S和5.8S片段的序列长度没有发生变化。罗非鱼5个种的ITS1序列的碱基组成差别不大。从UPGMA聚类结果上看,尼罗罗非鱼与尼奥罗非鱼聚为一支;莫桑比克罗非鱼与奥利亚罗非鱼聚为一支,红罗非鱼再与莫-奥聚合。[结论]五种罗非鱼的ITS1及18S、5.8S部分序列分析结果表明,尼罗和尼奥罗非鱼亲缘关系较近,奥利亚与莫桑比克罗非鱼亲缘关系较近,红罗非鱼可能与奥利亚和莫桑比克罗非鱼有一定的亲缘关系。

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