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宏基因组学揭示鳗鲡养殖环境微生物抗性基因的赋存特征

文献类型： 中文期刊

作者： 黄薇 1 ; 廖茜 2 ; 罗土炎 1 ; 宋永康 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室

2.福建省食品药品质量检验研究院

关键词： 鳗鲡;养殖环境;抗生素抗性基因;微生物群落结构;宏基因组学

期刊名称： 福建农业科技

ISSN： 0253-2301

年卷期： 2020 年 009 期

页码： 1-5

摘要： 为揭示鳗鲡养殖环境中抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的赋存特征,采集鳗鲡养殖环境样品(底泥和养殖水),利用高通量测序技术及功能宏基因组学分析方法对鳗鲡养殖环境中的A RG s种类和丰度进行研究.结果显示:鳗鲡养殖底泥和养殖水中的优势菌群结构组成具有明显差异,底泥的优势群体门类为Proteobacteria、Chloroflexi、Actinobacteria、Cyanobacteria、Gemmatimonadetes和Bacteroidetes;养殖水中的优势菌群门类为Proteobacteria、Bacteroidetes和Verrucomicrobia.比对抗性基因数据库,在底泥中共存在10类38种ARGs,在养殖水中共注释得到9类29种ARGs,其中高丰度的抗性类型为四环素类、磺胺类和杆菌肽类抗生素.研究结果可为抗生素在鳗鲡养殖过程中合理使用提供参考依据,同时也显示宏基因组测序技术在检测环境A RG s的可行性和优越性.

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