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大麦HhH-DGS全基因组鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王容 1 ; 蔡海亚 2 ; 焦春海 2 ; 安兵壮 1 ; 王红盼 1 ; 李博 1 ; 杨彩仙 1 ; 徐延浩 2 ;

作者机构: 1.长江大学农学院

2.湖北省农业科学院粮食作物研究所粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室

关键词: 大麦;HhH-DGS家族;碱基切除修复;表达模式;辐射应答

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 023 期

页码: 7657-7670

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 螺旋-发夹-螺旋DNA糖基化酶超基因家族(helix-hairpin-helix DNA glycosylases superfamily,HhH-DGS)是DNA碱基切除修复(base excision repair, BER)的关键酶之一,在保持基因组的稳定中发挥着重要作用。本研究分析了大麦(Hordeum vulgare L.) HhH-DGS基因家族的分子特征、系统发育、组织表达模式并探究了该基因家族对辐射的响应规律。在大麦基因组的6条染色体上共鉴定到15个HhH-DGS基因,系统发育将其分为9个亚群。不同亚族间HhH-DGS基因外显子数量变异很大,为2~12个。种间与种内共线性分析表明,该基因家族存在于单子叶与双子叶分化前,在大麦基因组内没有发生大规模扩增。HhH-DGS基因启动子含有大量的光调节因子。大麦萌发期的茎基部及花前期的顶端组织中HhH-DGS基因表达量显著高于其他组织器官;HhH-DGS基因HORVU.MOREX.r3.7HG0667530、HORVU.MOREX.r3.3HG0221280、HORVU.MOREX.r3.3HG0223220和HORVU.MOREX.r3.6HG0561680在大麦不同的器官中稳定表达,并在4种辐射处理后表达都上调。HORVU.MOREX.r3.5HG0469860、HORVU.MOREX.r3.7HG0634400和HORVU.MOREX.r3.1HG0074440表现出特异辐射方式响应模式。本研究在解析大麦HhH-DGS基因家族的特征、进化与功能的基础上,为大麦辐射育种提供了参考。

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