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基于线粒体COI基因序列的棘头梅童鱼7个野生群体遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵明 1 ; 宋炜 2 ; 马春艳 2 ; 张凤英 2 ; 蒋科技 2 ; 宋志明 2 ; 马凌波 2 ;

作者机构: 1.农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室

2.农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,中国水产科学研究院东海水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院

关键词: 棘头梅童鱼;COI基因;遗传结构;遗传多样性

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2015 年 22 卷 02 期

页码: 233-242

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用线粒体CO I序列为遗传标记分析了棘头梅童鱼(Collichthys lucidus Richardson)7个地理群体(江苏连云港、江苏大丰、上海崇明、浙江舟山、浙江温州、福建宁德和福建厦门)的遗传结构特征。在7个群体209个样本的线粒体CO I序列中共检测到44种单倍型。7个群体单倍型多样性为(0.416±0.112)~(0.720±0.076),核苷酸多样性为(0.001 10±0.000 35)~(0.004 44±0.001 64)。两个组群的AMOVA分析显示,南北两个组群分析组群间的变异为40.10%(P<0.01),组群间群体间的为–0.15%(P>0.05),群体内为60.05%(P<0.05),这与基于单倍型构建的NJ树、基于群体间遗传距离构建的UPGMA树的结果均表明棘头梅童鱼群体具有明显的谱系结构,以温州为分界点,温州以北为北方类群,以南则为南方类群。两群体之间的基因流数据表明南方与北方类群的基因交流受阻,结合各方面资料,推测更新世的演化历史因素为棘头梅童鱼南北分支形成的主要原因,而自身的生活习性则是南、北类群内部无明显分化的原因。其结果可以为合理开发和利用棘头梅童鱼野生资源,以及建立和保护棘头梅童鱼种质资源提供必要的参考。

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