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莲雾实时荧光定量PCR内参基因的筛选和验证

文献类型： 中文期刊

作者： 魏秀清 1 ; 章希娟 2 ; 许玲 2 ; 陈长忠 2 ; 许家辉 3 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院果树研究所;福建省农业科学院

2.;福建省农业科学院果树研究所;福建省农业科学院

3.;福建省农业科学院果树研究所;福建省农业科学院;

关键词： 莲雾;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 402-411

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】莲雾果实品质不稳定和冬季低温寒害是生产上的两大问题,筛选稳定可靠的内参基因,以便开展莲雾品质形成和低温胁迫响应分子机制研究。【方法】以‘紫红’‘黑珍珠’‘翡翠’3个莲雾品种为材料,利用qRT-PCR检测7个候选内参基因ACT-7、GAPDH、UBQ、α-TUB、CYP20-1、EF-2和APRT-5在果实发育和低温胁迫时的表达水平,通过geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件进行基因稳定性评价。【结果】不同软件分析结果不同,geNorm、NormFinder和RefFinder结果相似,果肉发育过程、果皮发育过程、低温胁迫下表达最稳定的内参基因分别是ACT-7、α-TUB和CYP20-1,BestKeeper则显示UBQ为表达最稳定的基因。用筛选的内参基因α-TUB和UBQ分析莲雾花青苷合成途径中F3H基因的表达,2者表达规律较一致。【结论】莲雾果肉发育过程、果皮发育过程、低温胁迫下最适的内参基因数分别为4个(ACT-7、GAPDH、UBQ、α-TUB)、2个(α-TUB、UBQ)和2个(CYP20-1、UBQ)。

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