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牙鲆微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王蕾 1 ; 张立冬 1 ; 万玉美 1 ; 谭照君 1 ; 孙效文 2 ;

作者机构： 1.大连海洋大学生命科学与技术学院

2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 牙鲆;微卫星;遗传结构

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2010 年 32 卷 10 期

页码： 1057-1064

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用生物素-磁珠吸附微卫星与质粒二次检测相结合的方法克隆牙鲆微卫星,并利用所得到的引物分析野生群体遗传结构。共获得2805个阳性克隆,测序得到3120个含微卫星的序列。其中完美型、非完美型和混合型分别占57.97%、7.25%和34.78%。用Primer3.0软件设计牙鲆微卫星引物,从中筛选出具稳定多态性的30对,分析中国黄海、渤海海域4个不同海区牙鲆野生群体(大连、北戴河、丹东、青岛)遗传结构。结果显示:有效等位基因数为3.93～9.94,平均为6.95;观测杂合度为0.532～0.895,平均为0.753;期望杂合度为0.635～0.902,平均为0.820;Hardy-Weinberg平衡指数(d)的变化范围为-0.247～0.512,其中7个位点表现为杂合子过剩(d>0),其余位点表现为杂合子缺失(d<0)。聚类分析显示:4个群体聚为两类,大连与丹东聚为一类,北戴河与青岛聚为一类。

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