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莆田豆梨GPX基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈义挺 1 ; 张长和 2 ; 陈婷 1 ; 陈招弟 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院果树研究所

2.福建省建宁县农业局

关键词： 地方种质资源;豆梨;GPX基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2015 年 09 期

页码： 868-873

摘要： 采用同源克隆RT-PCR结合RACE技术,从福建省地方梨种质资源莆田豆梨中克隆出GPX基因的cDNA全长序列分离克隆并运用生物信息学方法对序列进行分析。克隆得到福建省地方种质资源莆田豆梨GPX基因932bp的cDNA全长序列,分析表明,该序列的5′端和3′端的非编码序列长度分别为204bp和221bp,开放阅读框为507bp,编码168个氨基酸。氨基酸序列与苹果、柑橘、龙眼、荔枝的同源性90%以上。GPX基因在GenBank上登录,登录号为JQ011278。生物信息学分析表明:GPX蛋白的分子量是20 083.0Da,理论等电点pI 5.61,是不具跨膜结构域的亲水性胞质蛋白,不具有信号肽,细胞主要定位在细胞质上,有1个区域最有可能形成卷曲螺旋,由26.58%的a螺旋,19.26%的延伸链和54.16%的不规则卷曲组成,磷酸化位点有12个。此外,还对GPX酶分子三维立体结构等进行预测和分析。

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