文献类型： 中文期刊
作者： 王海亮 1 ; 李赟 1 ; 董萍萍 1 ; 宋晓玲 2 ; 黄倢 2 ;
作者机构： 1.中国海洋大学水产学院
2.中国水产科学研究院黄海水产研究所
关键词： 坚强芽孢杆菌;16S-23SrDNA间区;tRNA基因;多态性分析
期刊名称： 海洋与湖沼
ISSN： 0029-814X
年卷期： 2013 年 002 期
页码： 519-524
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 采用16S和23SrDNA保守区设计的引物对两株坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)16S-23SrDNA间区(Intergenic spacer region,ISR)进行了PCR扩增,并克隆到pMD18-T载体上进行测序;利用生物信息学进行了16S-23SrDNA间区序列及其内所含tRNA基因的分析.2株坚强芽孢杆菌共得到11条16S-23SrDNA间区特征区带(包括300、400、500和600bp等)序列,ISR类型包括ISR0、ISRG、ISRIA和ISRGLV四种,其中ISR0、ISRG和ISRIA可能在坚强芽孢杆菌中普遍存在.相同类型的ISR序列具有较高的相似性(达52.2%-100.0%),而不同类型的ISR序列间差异较大.此外,ISR序列在靠近16S和23S区域存在不同长度的保守区域,可能成为针对坚强芽孢杆菌特异性检测的引物和探针的靶区,这也为坚强芽孢杆菌新的检测方法的建立奠定了基础.坚强芽孢杆菌的16S-23SrDNA间区序列及其多态性分析均为首次报道.
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