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苏云金芽孢杆菌kurstaki亚种几丁质内切酶基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 阎文昭 1 ; 蔡平钟 1 ; 吴淑华 2 ; 方继朝 2 ;

作者机构： 1.四川省农业科学院生物技术核技术研究所

2.江苏省农业科学院植物保护研究所

关键词： 苏云金芽孢杆菌;几丁质酶;生物信息学

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2008 年 24 卷 06 期

页码： 89-93

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种(Bacillus thuringiensissubspkurstaki)基因组DNA为模板,利用1对特异性引物通过Touchdown PCR方法扩增了长为2 576 bp的几丁质酶kchi基因序列(GenBank登录号:AY189740)。生物信息学分析发现:该序列包含1个完整的开放阅读框,编码688个氨基酸,推测是分子量约为75 820。等电点pI=5.89的几丁质酶前体。序列和结构比较分析结果表明:Kchi属于几丁质内切酶,包括几丁质酶催化区、粘蛋白Ⅲ型同源区和几丁质结合区3个结构域,在N端还有1个分泌信号肽。除与Bt巴基斯坦亚种几丁质酶同源性较低(相似性为61.3%)外,与Bt其他亚种的同源性都较高(≥92.0%)。

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