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基于16S rRNA和Cyt b基因序列探讨2种梅童鱼的遗传分化

文献类型: 中文期刊

作者: 马国强 1 ; 高天翔 1 ; 孙典荣 2 ;

作者机构: 1.中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室

2.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词: 棘头梅童鱼;黑鳃梅童鱼;16S rRNA;Cytb;遗传分化

期刊名称: 南方水产

ISSN: 1673-2227

年卷期: 2010 年 6 卷 02 期

页码: 13-20

摘要: 比较分析了棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)和黑鳃梅童鱼(C.niveatus)的16SrRNA和Cytb基因片段序列差异及遗传分化程度。在长度为526bp的16S rRNA和379bp的Cytb基因片段的核苷酸序列中,2种间共检测到44处核苷酸替代。分析结果表明,2个基因片段的鸟嘌呤(G)含量较低,在Cytb蛋白质编码基因第三密码子位点上表现尤为明显。基于16S rRNA和Cytb基因片段分析结果显示,2种间平均遗传距离分别为0.012和0.111。构建的系统树显示2种梅童鱼在这2个基因片段上存在显著的遗传分化。根据Cytb基因2%/百万年的进化速率推断,棘头梅童鱼与黑鳃梅童鱼的分化时间约为550万年,发生于上新世(Pliocene)早期。

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