文献类型： 中文期刊
作者： 金龙飞 1 ; 尹欣幸 1 ; 曹红星 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室
关键词： 油棕;PYR/PYL/RCARs（PYL）基因家族;脱落酸;生物信息学;基因表达
期刊名称： 南方农业学报
ISSN：
年卷期： 2021 年 006 期
页码： 1545-1556
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】鉴定油棕（Elaeis guineensis）脱落酸（ABA）受体PYR/PYL/RCARs（PYL）基因家族成员,分析其表达特性,为探究ABA信号通路在油棕果肉成熟过程中的功能研究提供理论依据。【方法】以拟南芥和水稻的PYL蛋白氨基酸序列作为参考序列,通过BLASTp比对及保守结构域预测分析从油棕基因组中鉴定出PYL基因家族成员,利用生物信息学软件对其染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件及编码蛋白的理化性质、保守结构域、进化关系进行分析,并采用实时荧光定量PCR对PYL家族基因在不同组织、不同发育期果实及外源ABA处理下的表达特性进行检测。【结果】从油棕基因组中共鉴定出12个油棕PYL基因家族成员（EgPYL1～EgPYL112）,分布在8条染色体和1个Scaffolds上,含有1～3个外显子,开放阅读框（ORF）为564～765 bp,编码187～254个氨基酸,蛋白分子量为20.95～28.33 kD,等电点（pI）为5.26～7.95,不稳定指数为32.67～52.87,脂溶指数为73.87～87.60,总平均亲水性为-0.68～-0.17。12个PYL家族蛋白均含有特征结构域PYR/PYL/RCAR,分为3个亚族。Eg PYL1和EgPYL6基因具有共线性,EgPYL4、Eg PYL5、EgPYL9和EgPYL11基因具有共线性。EgPYLs基因的启动子上含有大量植物激素响应元件、逆境胁迫响应元件和光响应元件。EgPYLs基因在根、茎尖、叶、花和果肉中均有表达,但表达量差异较明显。EgPYL7、EgPYL8和EgPYL9基因的表达量随果肉成熟度增加逐渐升高,在23周达峰值。11个Eg PYLs基因均受外源ABA诱导表达。【结论】大多数PYL基因家族成员参与油棕对ABA的响应,且部分成员（如EgPYL7、EgPYL8和EgPYL9）在油棕果实发育中发挥重要的调控作用。
- 相关文献
[1]油棕EgGRF转录因子家族的全基因组鉴定与表达分析. 金龙飞,尹欣幸,曹红星. 2021
[2]油棕脂肪酸外运蛋白基因FAX1的克隆及表达分析. 金龙飞,李睿,曹红星,颜彦. 2022
[3]油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析. 杨蒙迪,金龙飞,周丽霞,窦雅静,曹红星,李新国. 2021
[4]油棕等植物γ-生育酚甲基转移酶的生物信息学分析. 石鹏,曹红星,李东霞,王永,雷新涛. 2015
[5]油棕等热带植物DXS基因的生物信息学分析. 石鹏,曹红星,李东霞,王永,雷新涛. 2016
[6]油棕WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析. 周丽霞,曹红星. 2020
[7]油棕油脂合成调控因子WRI1s的挖掘鉴定及表达分析. 周丽霞,杨蒙迪,张安妮,曹红星,杨耀东. 2022
[8]油棕花粉形态的观测及花粉萌发相关基因的表达研究. 李元元,杨蒙迪,曹红星,李新国. 2019
[9]油棕硼转运通道蛋白基因NIP5的克隆及其在缺硼下的表达分析. 金龙飞,尹欣幸,冯美利,周丽霞,曹红星. 2021
[10]外源ABA对木薯叶片内源激素及淀粉合成相关基因的影响. 王淑娟,方开星,陈新,马平安,周新成,卢诚,王文泉. 2015
[11]脱落酸喷施差异调控橡胶树热研73397和热研917生长和抗逆基因响应机制. 樊松乐,王纪坤,安锋,谢贵水,王立丰. 2021
[12]R2R3型MYB转录因子HbMYB88结构和功能分析. 樊松乐,王纪坤,谢贵水,王萌,王立丰. 2020
[13]外源ABA对木薯叶片β-胡萝卜素合成通路相关基因表达的影响. 邓昌哲,秦于玲,李开绵,陈松笔. 2017
[14]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013
[15]小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析. 黄鑫,夏百成,龙翔宇. 2016
[16]小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,杨丽娟,郑科,刘泽厚. 2014
[17]巴西橡胶树叶绿体型果糖-1,6-二磷酸酶基因的全长cDNA克隆与表达分析. 何斌,朱晋恒,龙翔宇,秦云霞,唐朝荣. 2015
[18]橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达. 龙翔宇,何斌,曹冰,梁启福,方永军,阳江华,唐朝荣. 2014
[19]玉米泛素活化酶基因家族鉴定及表达模式分析. 赵秋芳,贾利强,马海洋,陈曙,陈宏良. 2018
[20]橡胶树PGAM基因的克隆及表达特性分析. 龙翔宇,董绪浓,方永军,戚继艳,秦云霞,唐朝荣. 2013
作者其他论文 更多>>
-
基于SSR分子标记的油棕种质资源遗传多样性分析
作者：周丽霞;吴秋妃;李睿;冯美利;陈玲玲;曹红星
关键词：油棕;SSR分子标记;遗传多样性
-
油棕果实发育和采后脂肪酸合成转录代谢差异分析
作者：吴秋妃;杨程;张淑岩;韦露;冯美利;李睿;周丽霞;曹红星
关键词：油棕;游离脂肪酸;合成;转录组学;代谢组学
-
基于不同发育时期‘文椰5号’椰子水氨基酸代谢物的测评研究
作者：马雪静;曹红星;高艳明;孙程旭
关键词：椰子;'文椰5号';代谢物;氨基酸;精准测评
-
热带木本油料育种技术研究进展
作者：李睿;周丽霞;贾效成;林萍;杨程;徐玉芬;侯明明;曹红星
关键词：椰子;油棕;海南油茶;育种技术
-
三角种植模式对椰子生长影响的初步研究
作者：孙程旭;张芮宁;卢丽兰;尹欣幸
关键词：椰子;种植模式;三角;株高;茎围;倾斜
-
6个引进油棕品种农艺性状评价
作者：冯美利;张海清;曹红星
关键词：油棕;农艺性状;产油量;评价
-
油棕SAUR基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
作者：周丽霞;杨蒙迪;曹红星;杨耀东
关键词：油棕;SAUR;全基因组;生长素;生物信息分析;鉴定
