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普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈明丽 1 ; 王兰芬 1 ; 武晶 1 ; 张晓艳 2 ; 杨广东 3 ; 王述民 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院作物科学研究所

2.青岛市农业科学研究院蔬菜所

3.黑龙江省农业科学院克山分院

关键词: 普通菜豆;豇豆属;SSR 标记;通用性

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2014 年 40 卷 5 期

页码: 924-933

收录情况: CSCD

摘要: 分子标记具种属间通用性可提高其利用效率, 并降低标记开发成本。本研究基于Roche 454超高通量测序技术获得普通菜豆基因组测序结果, 共开发了560个普通菜豆基因组SSR 标记。利用2份普通菜豆品种对标记进行初步筛选, 有421个标记能够有效扩增。用新开发的标记分析16份豇豆和16份小豆的通用性。结果显示, 185个普通菜豆基因组SSR 标记在豇豆中能有效扩增, 通用性比率为43.9%; 161个SSR 标记在小豆中能有效扩增, 通用性比率为38.2%;在豇豆和小豆中都能获得有效扩增条带的标记共138个; 并且普通菜豆基因序列SSR 标记在豇豆和小豆中的通用性比率高于基因间序列SSR 标记。通用性标记的多态性分析表明, 豇豆和小豆的多态性比率分别为34.0%和24.8%; 且豇豆和小豆中基因间标记的多态性都比基因内标记的多态性高。上述通用性标记为豇豆属作物的多样性评价、连锁图谱的构建及基因定位等方面的研究提供了便利。

  • 相关文献

[1]普通菜豆基因组SSR标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析. 陈明丽,王兰芬,武晶,张晓艳,杨广东,王述民. 2014

[2]小麦微卫星标记在中间偃麦草中通用性研究. 王黎明,李兴锋,刘树兵,王洪刚. 2007

[3]普通菜豆新品种龙芸豆17的选育. 王强,孟宪欣,尹振功,魏淑红,郭怡璠,杨广东. 2022

[4]普通菜豆种质资源不同环境下表型差异及生态适应性评价. 王兰芬,武晶,王昭礼,陈吉宝,余莉,王强,王述民. 2018

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