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甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 彭琦 1 ; 陈松 2 ; 张维 2 ; 伍林涛 2 ; 周晓婴 2 ; 高建芹 2 ; 张洁夫 2 ; 戚存扣 2 ;

作者机构: 1.国家油菜改良中心南京分中心

2.国家油菜改良中心南京分中心,农业部长江下游棉花与油菜重点实验室,江苏省农业科学院经济作物研究所;贵州禾睦福种子有限公司

关键词: 甘蓝型油菜;PGIP家族;PGIP18;克隆;生物信息学分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2014 年 12 卷 04 期

页码: 67-73

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中克隆得到1个尚未报道的PGIP基因家族新成员——PGIP18。通过生物信息学分析发现,该基因的DNA具有1段长97bp的内含子序列和两段外显子序列,编码的氨基酸序列与甘蓝型油菜PGIP2亚家族蛋白同源性较高,且都由保守的N端信号肽和富含亮氨酸的LRR重复结构域组成。该基因的克隆为揭示油菜中内源PGIP基因的抗病机制和功能研究提供了新的基因资源。

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