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剑麻内参基因筛选与稳定表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张燕梅 1 ; 王瑞芳 1 ; 杨子平 1 ; 鹿志伟 1 ; 李俊峰 1 ; 赵艳龙 1 ; 陆军迎 1 ; 周文钊 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/湛江市热带作物遗传改良重点实验室

关键词: 剑麻;定量RT-PCR;内参基因

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2019 年 011 期

页码: 2166-2173

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了筛选剑麻中稳定表达的内参基因,保证基因表达结果的可靠性,本研究以热麻1号为材料,采用实时荧光定量RT-PCR方法对来自剑麻转录组数据的8个内参基因(EF1α、MADH、ACT2、GAPDH、TUB、ACT54、CYP和EF1β)在烟草疫霉侵染、水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)和脱落酸(ABA)处理过程中的表达水平进行检测,并结合GeNorm、BestKeeper和NormFinder软件综合评价8个内参基因的稳定性.结果表明:8个内参基因在不同处理下的表达稳定性存在显著差异,其中在烟草疫霉侵染和茉莉酸甲酯处理过程中,EF1α表达最稳定,EF1β表达最不稳定.在水杨酸处理过程中,EF1α表达最稳定,ACT2表达最不稳定.在脱落酸处理过程中,GAPDH表达最稳定,ACT54表达最不稳定.该结果为剑麻基因的表达分析提供了可供选择的内参基因.

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