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杧果CPP转录因子家族基因的鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨楠 1 ; 孙瑞青 1 ; 孙宇 1 ; 夏煜琪 1 ; 刘志鑫 2 ; 高庆远 1 ; 蒲金基 1 ; 党志国 3 ; 张贺 1 ;

作者机构: 1.海南大学热带作物学院

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室

3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 杧果;CPP转录因子;杧果细菌性黑斑病菌;杧果胶孢炭疽菌;qRT-PCR

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 005 期

页码: 1452-1462

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探索杧果(Mangifera indica L.)CPP(cysteine-rich polycomb-like protein)基因家族的序列特征与表达特征,通过生物信息学的方法对杧果CPP基因家族进行序列分析,并通过q RT-PCR技术研究杧果细菌性黑斑病菌(Xcm,Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae)和胶孢炭疽菌(Cg,Colletotrichum gloeosporioides)侵染过程中杧果CPP家族基因的转录水平和组织特异性表达水平。结果表明,从杧果基因组中鉴定了10个CPP基因家族成员,均含有保守的CRC结构域,均为不稳定疏水蛋白。与梨、长春花、胡杨、水稻、葡萄和拟南芥等6个物种69个CPP转录因子成员构建系统进化树,分为7个进化分支,杧果的10个CPPs基因分布在5个进化分支中,多和梨的CPP家族成员聚类在一起。qRT-PCR分析表明,在杧果细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,MiCPP1和MiCPP2在侵染3 h、6 h、12 h时上调表达;杧果胶孢炭疽菌(Cg)侵染的0~72 h时,MiCPP8呈上调表达,而MiCPP9则为下调表达;为后续开展杧果CPP基因家族成员响应病原菌侵染的机制研究奠定基础。qRT-PCR分析表明,MiCPP8在幼叶、花、芽中的相对表达量均很高,而MiCPP7在幼叶、花、芽中的相对表达量很低,MiCPP4与MiCPP9在幼叶、花中的相对表达量高而在芽中的表达量却很低,MiCPP6在花中的相对表达量很低,说明杧果MiCPPs基因家族成员在不同组织中具有表达的特异性。

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