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甲基磺酸乙酯对蒲公英胚性细胞基因表达的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 冯薇 1 ; 孟然 1 ; 李赵嘉 1 ; 吴哲 1 ; 鲁雪林 1 ; 陈悦 1 ; 王秀萍 1 ;

作者机构: 1.河北省农林科学院滨海农业研究所

关键词: 蒲公英;甲基磺酸乙酯;转录组测序;胡萝卜素;植物激素信号转导途径

期刊名称: 中草药

ISSN: 0253-2670

年卷期: 2025 年 56 卷 006 期

页码: 2111-2121

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的 对甲基磺酸乙酯(ethyl methanesulfonate,EMS)诱变下蒲公英Taraxacum mongolicum胚性细胞进行转录组测序,探究EMS诱变对蒲公英基因表达的影响。方法 利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对对照(CK)、0.15%EMS处理8 h后的蒲公英胚性细胞进行测序并建立c DNA数据库,经拼接后得到Unigene,并进一步开展生物信息学分析。结果共获得Unigene 45 551条,分别有32 954、12 923、21 752、28 115、9 764条被非冗余数据库(non-redundant protein sequence database,NR)、基因本体(gene ontology,GO)、Swiss-Prot、egg NOG、京都基因与基因组数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)等数据库注释,GO富集分析发现,蒲公英胚性细胞的DEGs在GO功能注释中主要集中于细胞过程、代谢过程、结合蛋白、氧化还原、催化活性等功能。KEGG途径富集结果表明,EMS诱变下DEGs显著富集在植物激素信号转导、光合作用、光合生物的固碳作用及光合作用-天线蛋白、胡萝卜素合成、不饱和脂肪酸代谢以及淀粉和糖代谢途径。EMS诱变能引起蒲公英胚性细胞植物激素信号转导途径关键酶基因的表达上调,响应胁迫。结论 通过转录组测序,初步表明EMS诱变下蒲公英胚性细胞差异基因的表达,并调控蒲公英胚性细胞中植物激素信号转导途径的相关酶基因,以期为从分子基因方面培育优质蒲公英提供参考和依据。

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