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我国禽脑脊髓炎病毒分离株全基因组的测定

文献类型: 中文期刊

作者: 韦莉 1 ; 刘爵 1 ; 姚炜光 1 ; 张方亮 1 ; 周蛟 1 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院畜牧兽医研究所

关键词: 禽脑脊髓炎病毒(AEV);核苷酸序列;氨基酸序列;测定

期刊名称: 病毒学报

ISSN: 1000-8721

年卷期: 2004 年 20 卷 03 期

页码: 230-236

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 测定了我国禽脑脊髓炎病毒(avianencephalomyelitisvirus,AEV)分离株L2Z株的全基因组核苷酸序列。该病毒株的3′和5′非编码区核苷酸序列用3′和5′RACE(cDNA末端快速扩增)法获得。基因组全长为7059个核苷酸残基,包括494个核苷酸残基的5′非编码区、6402个核苷酸残基的开放阅读框和136个核苷酸残基的3′非编码区及poly(A)尾巴。与已发表的AEV疫苗株1143的基因组序列比较发现,它们之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为98%和97 6%。结构蛋白(VP1~VP4)中,主要宿主保护性免疫原蛋白VP1氨基酸之间差异较小。与小RNA病毒科其它病毒属相比,在非结构蛋白3D中,预测的8个RNA依赖性RNA聚合酶主要结构域中的4个高度保守。从而进一步确认了AEV的分子特性。

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