您好，欢迎访问贵州省农业科学院 机构知识库！
贵州省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

火龙果转录组SSR的信息分析及其分子标记开发

文献类型： 中文期刊

作者： 王壮 1 ; 郑乾明 1 ; 成文韬 1 ; 毛永亚 1 ; 蔡永强 1 ; 马玉华 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院果树科学研究所

关键词： 火龙果;转录组;微卫星标记;多态性

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 1-5

摘要： 为火龙果种质资源的遗传多样性评价及品种分子鉴定提供参考,利用MISA软件对获得的Unigene进行筛选,以确定火龙果转录组的SSR位点及分布,进而利用Primer 3.0软件设计SSR引物,并利用PCR扩增筛选SSR多态性引物,根据SSR扩增产物的多态性,利用UPGMA方法对15个火龙果种质材料进行聚类分析。结果表明:在碱基序列总长度为54.975Mb的79 658条Unigene中,筛选得到16 523个SSR位点,分布于13 493条Unigene序列上,SSR位点的出现频率为20.74%,平均每3.33kb出现1个SSR位点;SSR的主要类型是单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复,其占比分别为59.58%、26.53%和12.93%;随机筛选获得的37对引物经PCR扩增,有23对引物可扩增出清晰条带,11对引物在15个火龙果种质材料中表现出多态性;UPGMA聚类分析将15个火龙果种质材料分为4类,其中,果肉为紫红色或粉红色的贵州紫红龙、贵州红肉-1和台湾红水晶等8个火龙果种质材料聚为Ⅰ类,果肉为红色或粉红色的贵州红龙、云南红肉-2和云南粉肉3个种质材料聚为Ⅱ类,果肉为白色的云南白肉-1、云南白肉-2和贵州野生白肉3个种质材料聚为Ⅲ类,果肉为紫红色的台湾黑龙火龙果种质材料单独为Ⅳ类。

  • 相关文献

[1]红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释. 吴亚维,徐娟,韩秀梅,张兴无,洪怡,文晓鹏. 2019

[2]火龙果响应PEG模拟干旱胁迫的转录组分析. 王爱华,马红叶,罗克明,文晓鹏. 2022

[3]基于转录组序列的火龙果SSR和SNP多态性分析. 严佳文,肖图舰,袁启凤,解璞,彭志军,毛永亚,马玉华. 2018

[4]火龙果营养研究及开发现状. 谢国芳,周俊良,韩秀梅,张银,杨月. 2013

[5]喀斯特山区火龙果栽培技术要点. 颜艳. 2014

[6]火龙果抗寒性检测初探. 邓仁菊,范建新,王彬,蔡永强. 2009

[7]2015年关岭县火龙果钾肥总控量试验初报. 甘南孝,朱安乐,左栋清,马艳,文凭,李裕荣. 2016

[8]罗甸县种植火龙果的气候适应性分析. 刘朝英,谭清波,石廷娅,韦茜. 2012

[9]火龙果嫁接栽培技术的多媒体课件制作. 文竹,冉争光. 2013

[10]火龙果新品种-黔果1号. 王彬. 2016

[11]火龙果茎段及花药愈伤组织内源激素含量的测定. 范建新,邓仁菊,王永清,罗立娜,韩树全,刘荣. 2017

[12]氮磷钾肥配施对火龙果产量及品质的影响. 李兴忠,范建新,邓仁菊,蔡永强,钟杰. 2012

[13]火龙果MSAP体系的优化及组培苗DNA甲基化检测. 刘鹏飞,乔光,刘涛,彭志军,蔡永强,晓鹏. 2016

[14]贵州南亚热带地区火龙果抗寒性调查. 金吉芬,郑伟,刘涛. 2010

[15]火龙果研究进展. 申世辉,马玉华,蔡永强. 2015

[16]火龙果类锌指蛋白基因片段的克隆及表达分析. 颜凤霞,晓鹏,乔光,刘涛. 2014

[17]基于RS与GIS的贵州省火龙果种植气候区划. 王旭,向青云,谭伟,蔡永强,范建新,邓仁菊. 2011

[18]关岭县火龙果种植适宜性评价. 彭开艳,孙长青,左栋清,杨丽,朱安乐,李裕荣. 2013

[19]行间种草对火龙果果园土壤特性及果实产量的影响初探. 蒙正兵,刘华荣,龙忠富,张瑜. 2016

[20]水分胁迫下火龙果生长模拟研究进展. 黎瑞君,岳延滨,童倩倩,李莉婕,赵泽英,孙长青,舒田. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：贵州省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台