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椰子GA代谢途径相关基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何贺 1 ; 夏薇 1 ; 王永 2 ; 张大鹏 2 ; 石鹏 2 ; 肖勇 2 ;

作者机构： 1.海南大学热带作物学院

2.中国热带农业科学院椰子研究所海南省热带油料作物生物学重点实验室

关键词： 椰子;赤霉素代谢途径;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 016 期

页码： 5290-5298

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 赤霉素(GAs)对植物生长发育具有重要的调控作用,本研究通过生物信息学方法对椰子GA代谢途径通路上有关基因的理化性质以及组织特异性表达进行分析,筛选出GA代谢相关基因45个,并对其结构、功能进行了预测.通过亚细胞定位分析发现,椰子GA代谢通路基因存在于细胞核、线粒体,且有功能蛋白翻译,这与GA代谢通路上相关蛋白的调控功能吻合.通过表达量数据分析发现在椰子不同组织中GA代谢相关基因的表达量存在差异,其中CnDELLA家族、CnGID1受体家族、CnFbox、CnSPY家族成员基因在胚、胚乳和胚愈伤组织中表达,表明其与幼苗期的生长发育有关,在椰子早期发育过程中可能存在DELLA蛋白的抑制作用.椰子GA代谢途径通路上相关基因研究对海南本地高、矮种育种的研究具有重要意义,通过对GA代谢途径通路上相关基因对比分析,为之后的研究提供理论支持.

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