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草莓白化伴随病毒RT-LAMP检测方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 王涌 1 ; 曾祥国 1 ; 肖桂林 1 ; 温昕 1 ; 周鑫鑫 1 ; 邓江丽 1 ; 韩永超 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院经济作物研究所

关键词: 草莓白化伴随病毒;反转录环介导等温扩增;可视化;快速检测

期刊名称: 植物保护

ISSN: 0529-1542

年卷期: 2024 年 50 卷 006 期

页码: 237-245,253

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 草莓白化伴随病毒(strawberry pallidosis-associated virus, SPaV)能引起草莓白化病,与其他病毒复合侵染后会加重症状。本研究建立了SPaV的反转录环介导等温扩增方法(reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP),对反应体系的各条件进行评估优化后,检测了RT-LAMP的特异性和灵敏度,且对田间样品进行了测试。结果表明,优化后的反应体系包含2.5μL 10×Isothermal Amplification Buffer、6 mmol/L Mg2+、1 mmol/L dNTPs、1μmol/L SPaV-FIP和SPaV-BIP,0.1μmol/L SPaV-F3和SPaV-B3,0.3μmol/L SPaV-LB,0.4 mol/L Betaine, 0.256 U/μL WarmStart Bst 2.0 DNA Polymerase, 0.12 U/μL WarmStart RTx Reverse Transcriptase, 1μL RNA,反应条件为61℃恒温孵育40 min。采用优化后的反应体系,在特异性检测中,只有携带了病毒SPaV的样品才能发生阳性扩增。灵敏度测试中,RT-LAMP比RT-PCR灵敏度高10倍。田间应用中,RT-LAMP和RT-PCR检测结果一致。本研究建立的SPaV RT-LAMP检测方法操作简便、快速、特异,可供实验室及生产实践中应用,助力脱毒种苗的鉴定和田间病毒病调查。

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