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青狗尾草Dof基因家族的全基因组鉴定及组织特异性表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 成亮 1 ; 刘宝玲 1 ; 刘盼 1 ; 邢恒荣 1 ; 张艾英 1 ; 张莉 1 ;

作者机构: 1.山西药科职业学院;山西农业大学农学院;山西省农业科学院谷子研究所

关键词: 青狗尾草;Dof家族;转录因子;组织特异表达

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 13 期

页码: 4226-4234

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 青狗尾草是禾本科狗尾草属的一种草本植物,随着基因组测序的完成,青狗尾草逐渐发展成为抗旱耐逆研究的模式植物。Dof(DNA binding with one finger)是植物特有转录因子基因家族之一,在植物生长发育的一系列生理生化反应过程中发挥重要作用。本研究对青狗尾草Dof转录因子基因家族的基因在染色体上的位置、基因结构、编码蛋白的理化性质和系统发育等方面进行分析。此外,还对该基因家族成员在不同的组织器官、发育阶段的表达进行了分析。研究结果发现青狗尾草基因组中存在36个Dof基因,命名为Sv Dof1~Sv Dof36。通过对青狗尾草、谷子、高粱、水稻和拟南芥Dof蛋白的系统发育关系分析,Dof基因家族可被分为6个亚组(Group 1~6)。利用狗尾草转录组数据,进一步研究了狗尾草Sv Dof基因在10中不同组织器官中的表达情况,结果显示Sevir.8G018500和Sevir.1G022000基因只在胚芽鞘中表达,Sevir.8G184900在叶分生组织和花序分生组织中呈现特异性表达,预示着这些Dof基因可能参与特定组织的发育。本研究结果为下一步鉴定Sv Dofs基因功能提供基础。

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