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玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙培元 1 ; 王俊强 1 ; 韩业辉 1 ; 于运凯 1 ; 许健 1 ; 周超 1 ; 李昕 2 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院齐齐哈尔分院

2.黑龙江省农业科学院五常水稻研究所

关键词： 玉米;RNA结合蛋白;GRMZM2G052926基因;生物信息学

期刊名称： 黑龙江农业科学

ISSN： 1002-2767

年卷期： 2016 年 03 期

页码： 7-12

摘要： 为了研究玉米RNA结合蛋白在玉米生长发育中的调节机制,以一个玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因为材料,采用生物信息学的方法,对其理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、功能域、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:基因包含一个1 335bp开放阅读框,是一种具有亲水能力的不稳定酸性蛋白,相对分子质量38.301 1kDa,包含两个RRM超亲家族(RRM superfamily),无信号肽序列,无跨膜结构域,亚细胞定位在细胞质上,二级结构由无规则卷曲、α螺旋、延伸链和β折叠构成;系统进化树分析表明,GRMZM2G052926蛋白与水稻Os05g0437300蛋白亲缘关系最近,同源性达到87%。

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