您好,欢迎访问上海市农业科学院 机构知识库!

番茄S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因SlSAMDC1的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘志勇 1 ; 王孝宣 1 ; 高建昌 1 ; 国艳梅 1 ; 杜永臣 1 ; 叶雪凌 2 ;

作者机构: 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

2.首都师范大学生命科学学院

关键词: 番茄;多胺;S-腺苷蛋氨酸脱羧酶;基因克隆

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2008 年 35 卷 08 期

页码: 1137-1146

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以蔓陀罗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶全长cDNA序列为信息探针,筛选NCBI番茄EST数据库,依据同源EST信息,经人工拼接、RT-PCR及RACE技术验证,获得了1个新的SAMDC基因家族成员,命名为SlSAMDC1(GenBank登录号:EF550528),并利用染色体步移技术克隆了879bp的上游调控区域。SlSAMDC1cDNA序列全长1847bp,5′-UTR和3′-UTR分别长523和241bp;存在3个ORF(微型uORF、小型uORF和主ORF),主ORF编码360个氨基酸的SAMDC酶原;SlSAMDC1基因组序列全长3648bp,有3个内含子,均位于5′-UTR,所有内含子的剪切位点均符合真核生物"GT-AG"规则。SlSAMDC1基因与其它植物来源SAMDC基因同源性较高,与人、大肠杆菌以及酵母的同源性较低。表达谱分析发现,SlSAM-DC1基因在番茄根、茎、叶、花蕾、果实等器官中均表达,果实中的表达量相对较高。生物信息学分析表明,SlSMDC1基因的上游调控序列存在多个顺式作用元件,如W-box、TATA-box、CAAT-box等。

  • 相关文献

[1]外源NO对NaCl胁迫下番茄幼苗生长及相关物质含量的影响. 吴雪霞,朱为民,陈建林,查丁石. 2008

[2]多胺缓解硝酸钙对小白菜幼苗生长抑制的作用. 鲁莹,束胜,朱为民,郭世荣,孙锦. 2015

[3]低温预处理对大麦花药内源游离氨基酸和多胺水平的影响. 黄剑华,陆瑞菊,王亦菲,孙月芳,周润梅. 2001

[4]番茄刺皮瘿螨(Aculops lycopersici)为害对番茄幼苗叶片叶绿素、类胡萝卜素及糖含量的影响. 吴娟,上海市设施园艺技术重点实验室,李琳一,上海市设施园艺技术重点实验室,许翔,杨益众,王冬生,上海市设施园艺技术重点实验室. 2005

[5]有机液肥在有机无土栽培中的应用技术研究. 史吉平,黄丹枫,董永华,姚永康. 2002

[6]连栋大棚多层覆盖下的温光条件及对番茄果实发育的影响. 朱为民,朱龙英,杨志杰,徐悌惟. 2002

[7]番茄RAPD技术反应体系条件的优化. 杨少军,扬州大学农学院园艺系,朱为民,上海农业科学院园艺研究所,杨晓锋,上海农业科学院园艺研究所,王霞,扬州大学农学院园艺系,薛林宝. 2006

[8]外源一氧化氮对NaCl胁迫下番茄幼苗生长和光合作用的影响. 吴雪霞,上海市农业科学院园艺研究所,朱月林,朱为民,陈建林. 2006

[9]番茄刺皮瘿螨研究进展. 王梅玉,王冬生. 2007

[10]遮荫处理对温室4种蔬菜生长及光合作用日变化的影响. 丁小涛,金海军,张红梅,余纪柱. 2009

[11]普通野生稻凝集基因的克隆及序列分析. 王亦菲,郝峥嵘. 2000

[12]一个小麦AP2/ERF转录因子家族单独亚族基因的克隆及分析. 庄静,陈建民,彭日荷,高峰,朱波,付晓燕,熊爱生,姚泉洪. 2009

[13]斑玉蕈甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因克隆与序列分析. 张津京,陈辉,冯志勇,陈明杰,汪虹. 2011

[14]水稻耐旱性基因OsERF65的克隆、表达及转录自激活活性分析. 赵慧,杨诗勤,徐凯,罗利军. 2021

[15]'红颜'草莓中果糖激酶基因FaFRK3的克隆与表达分析. 吕文远,张丽勍,高清华,段可. 2020

[16]猪IgG H链基因CH2-CH3的克隆和分析. 姜法铭,曹海军,朱志盈,姚惠娟,樊生超,华修国,崔立,缪德年. 2006

[17]甜菊(Stevia rebaudiana)糖基转移酶基因的克隆及序列分析. 马凌波,张大兵,沈明山,陈亮,陈睦传. 2002

[18]观赏植物基因工程研究进展及存在问题. 周音,张智奇,殷丽青,张建军. 2000

[19]油菜AP2/ERF家族转录因子的分离及其生物学功能. 庄静,熊爱生,彭日荷,陈建民,朱波. 2009

[20]矮牵牛DFR-A基因的克隆与表达分析. 褚云霞,陈海荣,潘俊松,吴爱忠,蔡润,邓姗. 2014

作者其他论文 更多>>