文献类型: 中文期刊
作者: 刘志勇 1 ; 王孝宣 1 ; 高建昌 1 ; 国艳梅 1 ; 杜永臣 1 ; 叶雪凌 2 ;
作者机构: 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所
2.首都师范大学生命科学学院
关键词: 番茄;多胺;S-腺苷蛋氨酸脱羧酶;基因克隆
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2008 年 35 卷 08 期
页码: 1137-1146
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以蔓陀罗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶全长cDNA序列为信息探针,筛选NCBI番茄EST数据库,依据同源EST信息,经人工拼接、RT-PCR及RACE技术验证,获得了1个新的SAMDC基因家族成员,命名为SlSAMDC1(GenBank登录号:EF550528),并利用染色体步移技术克隆了879bp的上游调控区域。SlSAMDC1cDNA序列全长1847bp,5′-UTR和3′-UTR分别长523和241bp;存在3个ORF(微型uORF、小型uORF和主ORF),主ORF编码360个氨基酸的SAMDC酶原;SlSAMDC1基因组序列全长3648bp,有3个内含子,均位于5′-UTR,所有内含子的剪切位点均符合真核生物"GT-AG"规则。SlSAMDC1基因与其它植物来源SAMDC基因同源性较高,与人、大肠杆菌以及酵母的同源性较低。表达谱分析发现,SlSAM-DC1基因在番茄根、茎、叶、花蕾、果实等器官中均表达,果实中的表达量相对较高。生物信息学分析表明,SlSMDC1基因的上游调控序列存在多个顺式作用元件,如W-box、TATA-box、CAAT-box等。
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