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百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张振鲁 1 ; 张佳诗 2 ; 隋丽 2 ; 李启云 2 ; 王金刚 3 ; 盛岩 1 ; 杜茜 2 ; 汪洋洲 2 ;

作者机构: 1.中国人民大学环境学院

2.吉林省农业科学院植物保护研究所/农业部东北农作物有害生物综合治理重点实验室

3.东北农业大学园艺学院

关键词: 百日草;几丁质酶基因;克隆;序列分析

期刊名称: 安徽农业科学

ISSN: 0517-6611

年卷期: 2013 年 25 期

页码: 10256-10258+10398

收录情况: 北大核心

摘要: [目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析。[方法]以百日草"梦境"系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序列进行分析。[结果]克隆得到的片段长度为227 bp,共编码75个氨基酸残基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi与已报道的其他植物几丁质酶基因同源性达70%以上,其中与葡萄的同源性最高,为74%;氨基酸同源性分析表明,该几丁质酶多肽属于18家族几丁质酶,且与已报道的其他植物几丁质酶氨基酸序列具有70%以上的相似性;氨基酸聚类分析表明,该几丁质酶多肽与白车轴草和蒺藜苜蓿的几丁质酶聚类;生物信息学分析表明,由该基因片段编码的多肽为非跨膜蛋白,主要含α螺旋和随机线圈螺旋等二级结构。[结论]该研究为进一步研究几丁质酶基因的功能奠定了基础。

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