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小麦幼苗内生菌多样性的宏基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵芹 1 ; 邓渊钰 1 ; 李伟 1 ; 孙海燕 1 ; 夏云磊 1 ; 陈怀谷 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院植物保护研究所

关键词： 小麦幼苗;内生菌;宏基因组;多样性;系统发育分析

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2017 年 47 卷 03 期

页码： 313-324

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 小麦是世界各地广泛种植的重要禾本科作物,在生长过程中与内生菌形成和谐共生的微生态体系,内生菌次生代谢产物具有抗病、防虫与促生等重要作用。宏基因组技术是研究环境微生物及内生菌多样性的重要手段。本研究首先富集纯化幼苗期小麦内生菌的宏基因组DNA,PCR扩增内生细菌的16S rDNA及内生真菌rDNA-ITS序列,构建了大肠杆菌克隆文库,选取阳性克隆测序。根据16S rDNA信息及系统进化树对内生细菌群初步分析,划分为9个分类操作单元(operational taxonomic unites,OTUs),主要包括γ-变形菌纲肠杆菌科(95.59%)、梭菌纲(1.47%)及不可培养细菌(2.94%),其中肠杆菌科菌群为优势菌。内生真菌rDNA-ITS克隆序列根据序列相似性和系统发育分析划归为13个OTUs,主要为不可培养真菌(37.50%)与子囊菌(62.50%),后者分属于半子囊菌纲(30.00%)、座囊菌纲(5.00%)与粪壳菌纲(27.50%)3个菌纲,其中不可培养真菌为优势菌。上述研究结果表明小麦幼苗内生菌遗传多样性分布较广,本研究为进一步挖掘利用小麦内生菌资源提供了基础信息。

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