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花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈湘瑜 1 ; 徐日荣 1 ; 林栩松 2 ; 唐兆秀 1 ;

作者机构： 1.农业部闽台农作物种质资源利用重点开放实验室

2.福建省福清市种子站

关键词： 花生;谷氨酸脱氢酶基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2016 年 31 卷 03 期

页码： 217-224

摘要： 运用电子克隆技术获得花生1个谷氨酸脱氢酶基因cDNA序列,同时设计引物以花生cDNA为模板进行扩增,经测序得到证实,命名为AhGDH1,GenBank登录号:KT933119。采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、基本理化性质、亚细胞定位、跨膜结构域、信号肽导肽、二级结构和三级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:该基因cDNA序列长度为1 713bp,包含1个1 236bp开放阅读框,编码411个氨基酸;该编码蛋白含有谷氨酸脱氢酶两个典型的保守结构域。同源比对分析显示,该基因编码的氨基酸序列与鹰嘴豆等植物的谷氨酸脱氢酶基因具有高度的相似性,进一步确定该蛋白为谷氨酸脱氢酶。

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