文献类型： 中文期刊
作者： 吴荣菊 1 ; 陈能刚 1 ; 李欢 1 ; 鄢小青 1 ; 杨占烈 2 ; 刘军 1 ;
作者机构： 1.贵州省农业科学院农作物品种资源研究所
2.贵州省水稻研究所
关键词： 水稻;纤维素合成酶;全基因组鉴定;生物信息学
期刊名称： 中国农业科技导报
ISSN： 1008-0864
年卷期： 2025 年 27 卷 011 期
页码： 83-92
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 水稻纤维素合成酶超基因家族由纤维素合成酶基因(cellulose synthase,CesA)和类纤维素合酶基因(cellulose synthase-like protein,Csl)组成,为了解水稻CesA/Csl家族成员序列特征及表达特性,探究其功能,利用生物信息学方法在水稻全基因组中鉴定OsCesA/Csl基因,并对其理化性质、保守基序、基因结构、系统进化、顺式作用元件、染色体定位和共线性等进行分析,利用转录组数据分析OsCesA/Csl的组织表达和不同植物激素处理下的表达.结果表明,在水稻基因组中共鉴定到22个OsCesA/Csl成员,基因编码序列(coding sequence,CDS)长度为774~3 648 bp,蛋白质分子量为28.55~132.16 kD,等电点为6.09~9.62,平均亲水系数为-0.339~0.750,亚细胞定位在细胞膜或高尔基体上.系统进化分为OsCesA和OsCsl,各包含11个成员,分布在除第11号以外的11条染色体上.水稻中存在2组串联重复基因,与玉米更具共线性关系.不同OsCesA/Csl成员的组织表达模式不同,均不同程度地响应茉莉酸、脱落酸、赤霉素和生长素处理.以上研究结果为进一步探索OsCesA/Csl基因家族在水稻生长发育中的功能奠定基础.
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