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巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴瑞 1 ; 朱家红 2 ; 张全琪 3 ; 张治礼 4 ;

作者机构： 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所

3.农业部热带生物技术重点开放实验室

4.海南省农业科学院

关键词： 巴西橡胶树;基因克隆;LIM基因;生物信息学

期刊名称： 热带生物学报

ISSN： 1674-7054

年卷期： 2010 年 1 卷 01 期

页码： 68-72

摘要： 根据乙烯利刺激巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)胶乳差异表达cDNA文库的EST序列信息,利用RACE技术从胶乳中成功克隆了1个含有LIM结构域的未知功能新基因HbLIM的全长cDNA。生物信息学分析表明,该基因全长cDNA由1016bp的碱基组成,拥有1个570bp的开放阅读框编码189个氨基酸残基;推测氨基酸序列富含Lys,Ser,Ala和Leu,含有2个LIM结构域和2个N-豆蔻酰化位置。序列相似性分析表明,HbLIM编码的氨基酸序列与蓖麻、杨毛、葡萄相应的LIM基因的相似性高达98%,95%和92%。这些研究结果为深入探讨LIM结构域蛋白在巴西橡胶树乳管发育及乳管代谢中的功能奠定了基础。

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