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大豆GmABCG40基因的功能预测及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李悦 1 ; 张宇航 2 ; 李冬梅 2 ; 王涛 2 ; 陈薇 2 ; 王珣 2 ; 李永光 2 ; 李文滨 3 ;

作者机构: 1.东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室;黑龙江省农业科学院生物技术研究所

2.;东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室;黑龙江省农业科学院生物技术研究所

3.;东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室;黑龙江省农业科学院生物技术研究所;

关键词: 大豆;ABCG转运蛋白;表达分析;功能;生物信息学

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2017 年 04 期

页码: 502-507

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥At ABCG40在大豆中的同源基因,获得了Gm ABCG40基因序列。通过对Gm ABCG40基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:Gm ABCG40基因CDS序列全长4 284 bp,编码1 427个氨基酸。Gm ABCG40编码的蛋白为疏水性蛋白,具有多个N-糖基化位点、激酶磷酸化位点、N-豆蔻酰化位点、2个ATP/GTP结合位点基序A和1个速激肽家族信号。结构域分析表明Gm ABCG40含有2个核苷酸结合域与2个跨膜结构域,形成NBD1-TMD1-NBD2-TMD2结构,属于ABCG亚家族的成员。Gm ABCG40预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、胚乳表达和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析表明Gm ABCG40与菜豆、红豆、木豆、百脉根等豆科植物亲缘关系较近。组织特异性表达分析结果显示Gm DABCG40在叶片中表达量最低,在根中表达量最高,推测其可能参与根中ABA的转运过程。

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