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东北野生大豆核心种质单核苷酸多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 孟爽 1 ; 赵洪锟 2 ; 袁翠平 2 ; 尹光 3 ; 刘晓冬 2 ; 王玉民 2 ; 董英山 2 ; 李建东 1 ;

作者机构: 1.沈阳农业大学农学院

2.吉林省农业科学院农业生物技术研究所

3.深圳市高级中学

关键词: 野生大豆;核心种质;SNP;Indel;遗传多样性

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2015 年 34 卷 02 期

页码: 185-190

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对196个东北野生大豆核心种质的NRT2、Asp AT2和CPK13三个基因片段进行单核苷酸扫描,共检测到94个SNPs位点及10个插入/缺失位点(Indel),碱基转换和颠换平均比例约2∶1。稀有SNPs位点(<10%)39个,比率约为41.5%。196份核心种质平均多态性位点比例约为74%,Shannon's指数是0.366,多样性指数为0.241;不同纬度群体的平均多样性指数随纬度下降逐渐升高,在44°N时达到峰值,然后随纬度降低缓慢下降,多样性指数变化呈近似正态曲线模式。初步推测N 42°~N45°区域为东北野生大豆的多样性中心。

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