文献类型： 中文期刊

作者： 刘洋 ¹ ; 姚艳丽 ² ; 胡小文 ² ; 徐磊 ² ; 高玉尧 ² ; 安东升 ³ ;

作者机构： 1.云南省甘蔗遗传改良重点实验室;中国热带农业科学院湛江实验站;广东省旱作节水农业工程技术研究中心

2.;云南省甘蔗遗传改良重点实验室;中国热带农业科学院湛江实验站;广东省旱作节水农业工程技术研究中心

3.;云南省甘蔗遗传改良重点实验室;中国热带农业科学院湛江实验站;广东省旱作节水农业工程技术研究中心;

关键词： 割手密;REMO基因;基因克隆;变异分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 2166-2174

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 割手密抗逆基因资源的挖掘是甘蔗抗逆育种的重要工作任务。本研究以前期转录组测序得到的割手密REMO基因c DNA序列为探针,对Gen Bank中的EST数据库进行同源检索,发现高粱REMO基因(XM_002465954.1)与其具有极高的相似性(94%)。利用高粱REMO基因(XM_002465954.1)设计同源引物,后经PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了7个割手密REMO基因c DNA序列(Ss REMO-1a,Ss REMO-1b,Ss REMO-1c,Ss REMO-1d,Ss REMO-1e,Ss REMO-1f,Ss REMO-1g,Gen Bank登录号为MF095088-MF095094)。7条序列全长均为738 bp,5'非翻译区(UTR)长度78 bp,3'UTR长度为96 bp,包含一个564 bp的开放读码框,编码187个氨基酸。分析表明此蛋白序列具有REMO保守结构域。Ss REMO-1a、Ss REMO-1b、Ss REMO-1c、Ss REMO-1d、Ss REMO-1e、Ss REMO-1f、Ss REMO-1g的相似性在98.9%~99.7%之间,存在14个单核苷酸多态性(SNP)位点,4个氨基酸变异位点,蛋白相似性在98.4%~100%之间。Ss REMO-1蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种具有较高的同源性,可分为两个亚类。