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基于EST和GSS序列的木豆miRNA生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李崇奇 1 ; 周鹏 2 ; 蔡望伟 3 ;

作者机构: 1.海南医学院生物化学与分子生物学教研室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所分析测试中心

3.海南大学农学院

关键词: 木豆;miRNA;EST;GSSQ74

期刊名称: 安徽农学通报

ISSN: 1007-7731

年卷期: 2014 年 10 期

页码: 17-19+67

摘要: 应用miRtour在线分析工具对木豆EST和GSS序列进行miRNA生物信息学预测,应用psRNATarget进行靶基因预测。结果发现,43条不同的木豆miRNA成熟序列,隶属于33个不同的miRNA家族。靶基因预测发现有36条编码序列受miRNA调控,其中17条序列编码酶,2条编码转录因子,7条编码参与细胞信号转导的蛋白,5条编码参与蛋白质降解通路的蛋白。

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