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基于转录组测序的青蟹寿锦化相关基因分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈汉鑫 1 ; 鞠玉栋 1 ; 万学锋 1 ;

作者机构： 1.福建省漳州市农业科学研究所;福建省农业科学院亚热带农业研究所

关键词： 多肉植物;锦化突变;转录组;光合作用

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 176-183

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】以青蟹寿及其全锦突变体qj为材料,研究多肉植物锦化变异分子机理。【方法】利用分光光度计法、转录组测序(RNA-seq),分别测量其叶绿素、类胡萝卜素含量及其相关基因的表达水平,并筛选差异显著的相关代谢途径。【结果】结果表明,qj的叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素的含量显著下降;对青蟹寿及qj叶片转录组测序分别获得44 988 938和37 271 576条Reads,经过滤拼接组装得到45 226条Unigene;所得Unigene的Nr注释分类中有26 999条,Swissport注释有20 279条,KOG注释有16 943条,KEGG注释有10 775条;筛选获得表达差异显著基因共20 305条,涉及130个途径,其中21个途径差异显著。筛选得到的叶绿素合成途径(ko00860)、天线蛋白(ko00196)和光合作用途径(ko00195)的基因表达对比分析,结果表明这3个途径的基因普遍显著下调表达。【结论】初步探索了多肉植物锦化变异的转录组信息,筛选到表达差异显著的基因及途径,为进一步研究多肉植物锦化变异机制提供了基础。

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