文献类型： 中文期刊

作者： 孙宇 ¹ ; 刘志鑫 ² ; 叶子 ¹ ; 罗睿雄 ³ ; 蒲金基 ² ; 张贺 ² ;

作者机构： 1.海南大学植物保护学院

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室

3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 杧果;Whirly基因家族;全基因组鉴定;表达分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2021 年 41 卷 001 期

页码： 37-45

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Whirly家族是一类植物特异的转录因子,无论在细胞核还是在细胞器内都有着广泛而复杂的生物学功能.该研究以杧果全基因组数据为基础,采用生物信息学的方法对杧果Whirly家族基因进行序列分析,并通过qRT-PCR技术分析杧果胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides,Cg)和细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae,Xcm)侵染过程中杧果Whirly家族基因的相对表达量.结果表明:(1)从杧果基因组中鉴定了3个Whirly基因家族成员,分别命名为MiWHY1、MiWHY2和MiWHY3.(2)杧果Whirly蛋白均为不稳定亲水碱性蛋白;系统发育树显示,杧果Whirly基因与木薯、毛果杨、番茄Whirly基因亲缘关系最近,杧果与木薯、毛果杨、番茄Whirly家族共有1个高度保守的基序Motif1;杧果Whirly家族均含有Whirly超家族保守域,主要结构元件为无规则卷曲和α-螺旋;保守结构域的四聚体结构与马铃薯Whirly蛋白四聚体结构具有高度相似性.(3)qRT-PCR结果显示,Cg侵染过程中,杧果Whirly基因的相对表达量均显著上调;Xcm侵染12 h时,MiWHY1和MiWHY3相对表达量显著上调,初步确定杧果Whirly基因表达响应胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌的侵染.研究认为,杧果中有3个Whirly基因家族成员,病菌侵染过程中可激发其表达活性,为后续研究杧果Whirly基因家族成员的功能和机制奠定基础.