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白桦BpCesA基因的生物信息学及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 申婷婷 1 ; 姜静 2 ; 刘桂丰 2 ; 许思佳 1 ; 李慧玉 3 ;

作者机构: 1.东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江省农业科学院经济作物研究所

2.东北林业大学

3.东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室

关键词: 白桦;纤维素;木质素;生物信息学;表达量

期刊名称: 植物研究

ISSN: 1673-5102

年卷期: 2016 年 36 卷 06 期

页码: 909-916

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从白桦45个转录组数据中分析获得6条白桦纤维素合成酶基因,其中2条为该家族的新基因,通过生物信息学及实时定量PCR技术探讨白桦Bp Ces A在不同材性白桦中的表达量情况。结果表明,6条白桦Bp Ces A基因的ORF长度在2 958~3 312 bp,编码的氨基酸数目在985~1 103 aa,相对分子量在110.40~124.29 k D,理论等电点为5.90~7.43;6条Bp Ces A均含有D,D,D,QXXRW保守结构域和8个跨膜螺旋,其中2个位于N端,6个位于C端。对来自6个双子叶植物,4个单子叶植物和1个裸子植物的52条Ces A进行了聚类分析发现:白桦Bp Ces A与同为木本的杨树Ptr Ces A具有较高的同源性,其中Bp Ces A2与Ptr Ces A3同源性达到92%、另外Bp Ces A5与Ptr Ces A6、Bp Ces A1与Ptr Ces A8也具有较高的同源性,分别为89%和82%。Bp Ces A1、Bp Ces A2、Bp Ces A3、Bp Ces A5基因随纤维素含量的增加,表达量也呈现增加趋势,推测这些基因在白桦的纤维素合成中起到促进的作用。本研究为揭示纤维素合成酶基因的功能分析提供了基础。

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