文献类型： 中文期刊
作者： 魏书军 1 ; 李冰艳 1 ; 曹利军 1 ; 朱家颖 2 ;
作者机构： 1.北京市农林科学院植物保护环境保护研究所
2.西南林业大学
关键词： RAD-seq;昆虫学;种群遗传学;物种界定;系统发育;遗传连锁图谱
期刊名称： 昆虫学报
ISSN： 0454-6296
年卷期： 2016 年 59 卷 07 期
页码： 767-774
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。
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