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‘芙蓉李’糖转运蛋白家族基因鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姜翠翠 1 ; 方智振 1 ; 周丹蓉 1 ; 林炎娟 1 ; 叶新福 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院果树研究所福建省落叶果树工程技术研究中心

关键词： 李;基因组;糖转运;基因家族;鉴定;生物信息学;表达分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2022 年 02 期

页码： 252-264

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于‘芙蓉李’（Prunus salicina）基因组数据，采用生物信息学分析方法鉴定糖转运蛋白家族基因，并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质保守结构域以及表达模式进行分析。共鉴定出49个该家族基因，根据保守结构域和系统发育分析将其分为7个亚家族。蛋白质介于313～948个氨基酸之间，预测定位于质膜或液泡膜；所有的蛋白都含有保守的糖转运体结构域（PF00083），其中大多数含有12个跨膜螺旋。通过比对‘芙蓉李’果实发育过程的RNA-seq数据，对49个基因进行表达谱分析，其中15个在果实不同发育阶段差异表达；qRT-PCR分析表明，15个差异表达基因中有9个基因与果实葡萄糖和蔗糖含量显著正/负相关，其中1个肌醇转运蛋白亚家族基因（PsINT4）、1个糖转运蛋白亚家族基因（PsSTP11）、1个糖促进蛋白亚家族基因（PsSFP5）和1个液泡单糖转运蛋白亚家族基因（PsTMT1）在‘芙蓉李’果实发育过程中具有较高的表达量，可能在‘芙蓉李’果实发育和成熟过程中对糖分积累起重要作用。

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