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香蕉MaTPS4基因序列及表达特性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 许桂莺 1 ; 徐碧玉 2 ; 邢文婷 3 ; 孙威 1 ; 王安邦 1 ; 宋顺 1 ; 陈青 4 ; 李科明 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院海口实验站

2.中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所

3.海南省林业科学研究所

4.中国热带农业科学院橡胶研究所

关键词: 香蕉;海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS4);生物信息学;表达分析

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2016 年 37 卷 03 期

页码: 532-538

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过随机克隆测序法从香蕉根系c DNA文库中获得海藻糖合成酶基因,命名为MaTPS4,全长c DNA序列为2 930 bp,含一个完整的开放阅读框2 574 bp,编码857个氨基酸。生物学信息分析表明,MaTPS4蛋白属于不稳定、疏水性蛋白,pI5.59,结构域TPS和TPP。序列预测分析表明,MaTPS4蛋白定位于细胞质中,具有3个跨膜区域,不存在信号肽。与其他已知植物TPS氨基酸序列同源比对,同源性达到84.90%;进化关系分析表明,香蕉MaTPS4氨基酸与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)聚为一类,二者亲缘关系较近,同源性为99%。器官特异性分析表明,MaTPS4在香蕉根系、球茎、假茎、叶、花、果实各器官中均有表达,其中球茎、假茎、叶片和花中表达量较大,根及果实中表达量极少。q RT-PCR分析表明,MaTPS4在根系中的表达经干旱、盐胁迫后均增强,其中盐胁迫24 h时MaTPS4表达量较0 h时高5倍;冷胁迫下,MaTPS4表达量增加,并随时间延长下降,在6 h达到最大;ABA胁迫下,MaTPS4表达量增加,为0 h的5倍;在ACC和Foc TR4胁迫下,MaTPS4表达无变化。因此,MaTPS4可能通过依赖ABA途径调控抗逆胁迫相关基因表达,提高植株对非生物胁迫的抗逆性。

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