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长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王旭歌 1 ; 何勇凤 2 ; 吴兴兵 2 ; 杨德国 3 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水生物多样性保护重点实验室;上海海洋大学

2.;中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水生物多样性保护重点实验室;上海海洋大学

3.;中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水生物多样性保护重点实验室;上海海洋大学;

关键词： 短颌鲚;D-loop;遗传多样性;遗传分化;地理群体

期刊名称： 动物学杂志

ISSN： 0250-3263

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 106-113

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探明长江中下游不同湖泊中短颌鲚(Coilia brachygnathus)遗传多样性水平和遗传分化程度,以洞庭湖、长湖、巢湖3个地理群体作为研究对象,采用线粒体控制区序列为分子标记,分别应用软件Dna SP 5.0、Arlequin3.1.1、MEGA5.0和Network 5.1进行了遗传参数统计和单倍型间分子变异分析(AMOVA),构建邻接系统树及单倍型网络图。对长江中下游短颌鲚野生群体的遗传多样性和遗传结构进行分析。结果显示,用来分析的1 236 bp D-loop区序列中共90个变异位点,54个简约信息位点。长江中下游3个地理群体中共发现58个单倍型,单倍型多样性(h)范围0.949~0.982,核苷酸多样性范围0.004 99~0.006 21,说明长江中下游3个湖泊短颌鲚地理群体具有较高的遗传多样性水平。3个短颌鲚地理群体遗传分化指数(Fst)为0.265 95,呈现出中等程度的分化水平,主要表现在巢湖群体与其他群体之间处于中等程度分化水平。依据遗传距离构建系统发育树及单倍型网络图也出现相类似结果。

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