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玉米扩展蛋白Expansin基因家族定位及基因表达模式分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姜志磊 1 ; 周琳 2 ; 武奉慈 2 ; 宋新元 3 ;

作者机构： 1.吉林省农业科学院农业生物技术研究所吉林省农业生物技术重点实验室

2.;吉林省农业科学院农业生物技术研究所吉林省农业生物技术重点实验室

3.;吉林省农业科学院农业生物技术研究所吉林省农业生物技术重点实验室;

关键词： 玉米;扩展蛋白;生物信息学

期刊名称： 生物技术进展

ISSN： 2095-2341

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 34-40+93

摘要： 扩展蛋白(Expansin)是一类能够使植物细胞壁松弛的活性蛋白,在植物生长发育过程中起着重要作用。利用PLAZA、NCBI、Maize GDB、Uniprot、PLEXdb等基因组数据库,获得玉米Expansin家族的基因序列、染色体基因座位、蛋白质序列以及长度,构建玉米Expansin基因家族系统进化树,进行基因组织表达谱的分析。结果表明,玉米基因组中含有93个Expansin基因,分布于玉米的9条染色体上;多数Expansin具有250~300个氨基酸;玉米Expansin基因家族有40个Expansin A(EXPA)、47个Expansin B(EXPB)、6个Expansin-like A(EXLA),未发现Expansin-like B(EXLB);44个玉米Expansin基因在不同玉米组织中特异表达。该研究结果不仅为玉米扩展蛋白的深入研究奠定了基础,而且为其他研究人员对基因信息的获取提供了参考。

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