您好,欢迎访问河南省农业科学院 机构知识库!

玉米生长素应答因子ARF基因家族的全基因组鉴定及表达特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 马晨晨 1 ; 叶飞宇 1 ; 张晓东 2 ; 胡德升 1 ; 田艳雨 1 ; 孙文鑫 2 ; 李果 1 ; 邓亚洲 1 ; 曹丽茹 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院粮食作物研究所

2.河南秋乐种业科技股份有限公司

关键词: 玉米;生长素响应因子;生物信息学;表达模式

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2025 年 44 卷 010 期

页码: 11-20,36

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 干旱胁迫是制约玉米生产的关键非生物逆境因素之一。为了探究玉米生长素应答因子(ARF)在响应干旱胁迫过程中的生理功能及作用机制,以玉米品种郑8713为试验材料,基于全基因组分析,对玉米ARF基因家族成员进行了鉴定和生物信息学分析,并利用RT-qPCR技术分析了相关基因在干旱胁迫条件下的表达模式。结果表明,在玉米基因组中共鉴定出28个ARF基因。理化性质分析显示,ARF蛋白的氨基酸数为511~1 152个,等电点范围为5.70~8.08,均为亲水性且不稳定的蛋白质。亚细胞定位预测结果表明,28个ZmARF家族成员均定位于细胞核内。系统发育分析发现,玉米ARF家族成员可划分为5个亚族,且多数基因与高粱和水稻具有较高的同源性。保守结构域分析表明,所有ARF蛋白均含有Auxin_resp和B3保守结构域,其启动子区域富含脱落酸响应元件和茉莉酸甲酯响应元件。组织特异性表达分析表明,28个ZmARF基因在检测的组织中均有表达,且同一亚家族基因的表达模式较为相似。干旱胁迫下的表达特性分析显示,大多数ZmARFs在受到干旱胁迫时表达量显著增加或降低。

  • 相关文献

[1]玉米生长素响应因子基因ZmARF10在干旱胁迫中的功能分析. 曹丽茹,叶飞宇,李伟亚,马晨晨,庞芸芸,梁小菡,张新,鲁晓民. 2024

[2]玉米生长素响应因子基因家族全基因组鉴定及表达分析. 曹丽茹,张前进,郭子宁,鲁晓民,张新,魏昕,皇甫柏树,王振华. 2021

[3]玉米干旱诱导表达基因ZmCKS2的克隆与表达分析. 黎裕,张中保,卢敏,李会勇,张登峰,刘颖慧,石云素,宋燕春,王天宇. 2010

[4]玉米干旱诱导表达基因ZmBTF3b的克隆与表达分析. 张中保,张登峰,李会勇,刘颖慧,石云素,宋燕春,王天宇,黎裕. 2010

[5]玉米逆境胁迫响应基因ZmTPR1的表达和功能分析. 曹丽茹,梁小菡,马晨晨,叶飞宇,庞芸芸,李伟亚,张新,鲁晓民. 2024

[6]玉米茎腐病致病菌全基因组分泌蛋白预测与分析. 曹言勇,张立立,李慧敏,韩胜博,侯梦薇,段灿星,施艳,张新友. 2024

[7]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017

[8]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽. 2019

[9]辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析. 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,姜俊,张晓伟. 2019

[10]甘蓝型油菜几丁质酶基因家族进化及其应答病菌的表达分析(英文). 徐文,周腾胜,鲁丹丹,安素妨,侯锦娜,栗根义. 2020

[11]小麦Mlo基因的克隆及白粉病菌诱导下的表达模式分析. 徐红明,刘红彦,王俊美,田保明,王鹏涛. 2010

[12]白粉菌诱导的小麦类萌发素蛋白的克隆、定位及表达分析. 王俊美,孙燕飞,刘红彦,康振生,徐红明. 2009

[13]全基因组水平金银花TCP基因家族的鉴定及表达模式分析. 谭政委,郭水柱,苏小雨,孙瑶,余永亮,李磊,张利超,许兰杰,鲁丹丹,安素妨,李春明,梁慧珍,王子君. 2024

[14]红花CtWRKY7和CtWRKY72基因的克隆及功能分析. 鲁丹丹,苏小雨,谭政委,余永亮,李磊,许兰杰,杨青,梁慧珍. 2024

[15]不同品种忍冬ANR基因克隆、表达模式及原核表达分析. 余永亮,鲁丹丹,谭政委,杨红旗,李磊,许兰杰,杨青,董薇,安素妨,郭水柱,高松,梁慧珍. 2023

[16]茎点枯病菌诱导后芝麻过氧化物酶活性变化及其基因表达分析. 刘莉铭,刘红彦,田保明,赵辉,王俊美. 2012

[17]红花CtANR2和CtANR3基因的克隆、结构及表达模式分析. 鲁丹丹,谭政委,余永亮,李磊,许兰杰,杨红旗,杨青,董薇,安素妨,梁慧珍. 2023

[18]小麦红吸浆虫唾腺EST序列的生物信息学分析. 段云,武予清,蒋月丽,苗进,吴仁海. 2010

[19]铁棍山药SUS基因CDS区克隆与生物信息学分析. 刘苏伟,文艺,张骆琪,高素霞,刘玉霞,王飞,鲁传涛,刘红彦. 2019

[20]基于高通量测序的麦红吸浆虫转录组分析. 蒋月丽,李彤,武予清,苗进,巩中军,段云,刘启航. 2020

作者其他论文 更多>>