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新疆雪莲全长cDNA文库构建及表达序列标签(ESTs)特性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王博 1 ; 艾秀莲 1 ; 王志方 1 ; 李芳 2 ; 罗明 3 ;

作者机构： 1.新疆农科院微生物所

2.新疆分析测试研究院

3.新疆农业大学

关键词： 新疆雪莲;cDNA文库;λTripLEx2;表达序列标签

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2008 年 45 卷 01 期

页码： 56-60

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以野生新疆雪莲(Saussurea involucrata Kar.et Kit)为研究材料,利用Creator SMARTTMcDNA Library Construction技术构建了雪莲全长cDNA文库,从野生雪莲中提取总RNA和mRNA,用分离到的微量mRNA合成cDNA第1链。通过长距离PCR扩增得到足够量的双链cDNA。将SfiⅠ酶切后并纯化的cDNA片段连接到经SfiⅠ酶切的噬菌体λTripIEX2上,并对噬菌体进行包装,建成cDNA的全长库。经大肠杆菌XL1-Blue平板检测,原始文库滴度达4.03×107(pfu/mL)。随机挑选500个克隆进行序列测定,PCR鉴定结果显示多数插入片段均在500 bp以上。将所测序列经GenBank检索和生物信息学比较,共有56个序列为非冗余数据。其中有14个cDNA片段序列在GenBank上无明显的同源性,42个片段与已报道的基因有较高的同源性。这些EST数据为进一步筛选和克隆雪莲特异性表达基因提供了材料平台,为雪莲基因组数据增补了大量信息。

  • 相关文献

[1]新疆雪莲胚性愈伤组织的诱导及原生质体分离. 袁永娴,王晓军,郝秀英,赵民安,朱金刚,祁鑫星,牛力涛. 2010

[2]新疆雪莲组织培养体系的优化. 胡雪梅,秦丽,贺宾,闫建庆,高燕,多力坤·沙比尔,沙红,兰海燕,张富春. 2007

[3]新疆雪莲多倍体的诱导初探. 张蜀敏,王晓军,郝秀英,徐琴,陈阳,刘传军,曹玉锦,欧阳立恒. 2008

[4]新疆雪莲的氨基酸组成. 张敏,乔坤云,郭辉. 2002

[5]应用差减杂交筛选雪莲低温特异表达基因. 王博,艾秀莲,王志方,李芳,罗明,张学军. 2007

[6]黄地老虎颗粒体病毒cDNA文库的构建. 张伟,王玮,艾秀莲,谢玉清,冯怀蓉. 2003

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