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小麦祖先种A组/D组与水稻基因组比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 许陶瑜 1 ; 王长彪 1 ; 韩斌 1 ; 赵兴华 1 ; 刘江 1 ; 任永康 1 ; 牛瑜琦 1 ; 唐朝晖 1 ;

作者机构: 1.山西大学生物工程学院;山西省农业科学院经济作物研究所;山西省农业科学院生物技术研究中心;山西省农业科学院

关键词: 小麦祖先种;水稻;核苷酸序列比对;基因比对;染色体进化

期刊名称: 山西农业科学

ISSN: 1002-2481

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 927-930+956

摘要: 为深入研究小麦祖先种乌拉尔图小麦、粗山羊草的遗传基础、分子结构、进化关系,试验将水稻基因组作为参考基因组进行Blast全基因组比较分析,筛选出8 259条长度4 kb以上的水稻同源核苷酸序列用circos软件和mauve软件作图。结果表明,小麦祖先种和水稻中存在大量同源核苷酸序列的同线性和共线性排列;祖先种与水稻基因共线性分析表明,3个物种间存在染色体上的共线性,共线性比例达80%以上,并用基因共线性关系对小麦祖先种染色体进化进行了阐述。

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