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基于叶绿体DNA变异的湖北梨属种质系统进化及遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张靖国 1 ; 曹玉芬 2 ; 陈启亮 1 ; 杨晓平 1 ; 范净 1 ; 田瑞 1 ; 胡红菊 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院果树茶叶研究所

2.中国农业科学院果树研究所

关键词: 梨属;叶绿体DNA;湖北;遗传多样性

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2016 年 17 卷 04 期

页码: 766-772

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用trnL intron、trnL-trnF、trnS-psbC和accD-psa I等4个叶绿体DNA片段对来自湖北省的88份梨属种质资源进行系统进化和遗传多样性分析。结果表明,4个cpDNA片段共检测到变异位点11个,其中单一突变位点6个,插入/缺失(Indel)位点5个。acc D-psa I多态性最高,其变异位点数、核苷酸多态性和单倍型多样性均为最高。供试梨种质的核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.00112和0.769;Tajima's D检验值在P>0.10水平上均不显著,表明所检测的4个区域以及合并后的片段均遵循中性进化模型;4个序列合并共检测到叶绿体单倍型10个,其中兴山梨种质中检测到的单倍型最多,荆门其次;Hap2和Hap5是2个主要单倍型,分别占总样本数的31.82%和30.68%;中介邻接网络图显示东方梨和西洋梨独立进化,而较为原始的稀有单倍型Hap8和Hap9均位于荆门,暗示该地区可能为砂梨的起源中心或多样性中心之一。

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