文献类型： 中文期刊
作者： 侯梦薇 1 ; 汪文睿 1 ; 曹言勇 2 ; 吴晓林 1 ; 李会勇 2 ;
作者机构： 1.河南农业大学生命科学学院
2.河南省农业科学院粮食作物研究所
关键词： 玉米亚种NB;线粒体基因组;密码子偏好性;最优密码子
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2025 年 23 卷 011 期
页码： 3532-3539
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为研究玉米(Zea mays)线粒体基因组的密码子偏好性，本研究以玉米亚种NB线粒体基因组为例，筛选出155条编码基因序列，通过生物信息学方法分析其密码子的使用模式。结果显示，玉米亚种NB线粒体基因组所编码基因密码子的GC含量与第一、第二和第三各位点的GC含量均小于50%(GC1, GC2, GC3)，表明玉米亚种NB线粒体编码基因富含A和T碱基；有效密码子数(effective number of codons, Nc)与GC、GC1、GC2、GC3、GC3s均正相关；相对同义密码子使用频率(RSCU)>1的同义密码子共有28个，其中仅有3个以G/C结尾，表明密码子的第3位碱基使用偏好于A/T；中性绘图和Nc-plot分析发现选择压力可能是导致玉米线粒体基因组密码子使用模式之间差异的主要原因；最终通过高表达优越密码子方法确定了TTT、TTA、CTC等17个最优密码子，其中以A/T碱基结尾的最优密码子有12个。本研究结果有助于更好地了解玉米线粒体基因组密码子偏好性规律，为提高外源基因在线粒体中的表达效率提供了科学依据。
- 相关文献
[1]11种植物psbA基因的密码子偏好性及聚类分析. 晁岳恩,吴政卿,杨会民,何宁,杨攀. 2011
[2]7种作物叶绿体基因的密码子偏好性及聚类分析. 晁岳恩,常阳,王美芳,何盛莲,赵献林,雷振生. 2012
作者其他论文 更多>>
-
河南省水稻种质资源调查收集与鉴定评价
作者：杨文博;秦子钰;马锦霞;王生轩;王能波;李晶晶;曹言勇
关键词：水稻;种质资源;普查收集;鉴定评价;河南省
-
整合转录组和代谢组学分析揭示玉米对层出镰孢茎腐病的响应机制
作者：曹言勇;程泽强;马娟;杨文博;朱卫红;孙新艳;李慧敏;夏来坤;段灿星
关键词：转录组;代谢组;玉米茎腐病;层出镰孢;苯丙氨酸代谢
-
基于转录组和蛋白质组学技术挖掘玉米抗拟轮枝镰孢茎腐病的潜在候选基因
作者：曹言勇;程泽强;朱卫红;杨文博;马娟;李慧敏;孙新艳;段灿星;夏来坤
关键词：玉米;茎腐病;转录组测序;亚油酸代谢
-
河南省不同生态区玉米品种密度效应及稳产适应性分析
作者：丁勇;宋淼;张留声;穆心愿;乔江方;刘桂珍;李会勇;张香粉;夏来坤
关键词：夏玉米;耐密性;品种—环境互作;AMMI模型;GGE双标图;籽粒产量;河南省
-
玉米茎秆抗倒伏相关性状全基因组关联分析
作者：王利锋;李晶晶;夏彦;王森;蔡齐宗;马锦霞;秦子钰;王浩;周柯;杨继伟;贾腾蛟;张站壹;王景;李会勇
关键词：玉米;茎秆;抗倒伏;全基因组关联分析
-
玉米茎腐病致病菌全基因组分泌蛋白预测与分析
作者：曹言勇;张立立;李慧敏;韩胜博;侯梦薇;段灿星;施艳;张新友
关键词：玉米;九州镰孢菌;生物信息学;分泌蛋白
-
玉米杂交群体产量性状及其特殊配合力全基因组关联分析
作者：马娟;曹言勇
关键词：玉米;杂交种;特殊配合力;全基因组关联分析
