您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 闵霞 1 ; 贾智英 1 ; 李池陶 1 ; 李飞 1 ; 石连玉 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: MHC;鲤鱼;多态性;多态核苷酸位点;连锁不平衡

期刊名称: 安徽农业大学学报

ISSN: 1672-352X

年卷期: 2012 年 39 卷 02 期

页码: 195-200

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据已克隆的鲤鱼MHC Ⅱ B基因序列,设计1对特异性引物,采用PCR-SSCP方法对6个鲤鱼群体MHC Ⅱ B基因第3外显子108 bp扩增片段进行多态性分析,结果共获得7种基因型(A-G),其中基因型为B型的个体数占所有群体总个体数的47.45%,且分布于所有群体,其它6种基因型出现频率范围为1.1%~17.15%。回收不同基因型的片段并测序,经比对共发现4个碱基多态位点和3个氨基酸多态位点。易捕鲤和大头鲤两群体中各发现4个突变位点(占3.7%);松荷鲤、松浦鲤和德国镜鲤群体各发现3个突变位点(占2.7%);松浦镜鲤群体仅发现2个突变位点(占1.8%)。用Popgene软件计算每个群体不同位点的杂合度和多态信息含量(PIC),6个鲤鱼群体的观测杂合度(Ho)最大值为0.746 4,最小值为0.103 7;多态信息含量为0.062 3~0.360 9。该研究将为今后深入研究鲤鱼MHC基因多态性及与鲤鱼抗病新品种的选育提供理论依据。

  • 相关文献

[1]Development of MHC Class I and II B Primers in Common Carp and its Molecular Characterization. Jia, Zhiying,Chi, Xifeng,Li, Chitao,Shi, Lianyu,Chi, Xifeng. 2010

[2]大菱鲆MHCⅡB基因全长CDNA的克隆与组织表达分析. 张玉喜,陈松林. 2006

[3]中草药添加剂对山女鳟体内MHC及IL-1β含量的影响. 王荻,穆桂强,刘红柏. 2013

[4]甲醛及孔雀石绿对哲罗鲑发眼卵MHC及IL-1β含量的影响. 李绍戊,王荻,卢彤岩. 2013

[5]大菱鲆(Scophthalmus maximus)MHCⅡA基因全长cDNA的克隆与组织表达分析. 张玉喜,陈松林. 2007

[6]败血症鲢肝与肾cDNA文库构建及MHC classⅠ的克隆与分析. 汪登强,罗晓松,陈大庆. 2011

[7]鱼类MHC及其基因研究进展. 徐田军,陈松林. 2008

[8]半滑舌鳎有效群体大小估计. 王伟峰,崔瑜,蒋丽,王悦玲,王焕岭,李恒德. 2019

[9]刀鲚内皮素1基因SNP多态性及其与颌骨性状相关联分析. 高俊,周琳,聂志娟,王耀辉,徐钢春. 2023

[10]尼罗罗非鱼β_2m基因SNP位点和单倍型与无乳链球菌抗性的关联分析. 张栋,高风英,卢迈新,曹建萌,刘志刚,可小丽,王淼. 2018

[11]鲤鳞被SLC25A5基因的克隆和表达分析. 张保勇,蒋丽,程安达,王书,孙效文. 2012

[12]鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位. 常玉梅,高国强,徐丽华,刘金亮,刘春雷,梁利群. 2010

[13]鲤鱼(Cyprinus carpio L.)体重和体长QTL的定位. 刘继红,张研,常玉梅,梁利群,张晓峰,鲁翠云,徐美佳,孙效文. 2009

[14]低温胁迫对鲤血清生化指标的影响. 常玉梅,曹鼎臣,孙效文,梁利群. 2006

[15]鲤鱼cDNA-AFLP技术反应体系的建立. 李飞,贾智英,闵霞,石连玉. 2011

[16]液相色谱串联质谱测定磺胺间甲氧嘧啶与鲤鱼血浆蛋白结合率. 孙言春,王瑛,杜宁宁,吴松,牟振波,汤施展. 2012

[17]利用EST-SSR座位对鲤鱼几种生长性状的单标记回归分析. 徐美佳,张研,鲁翠云,张晓峰,刘继红,孙效文. 2009

[18]丁香油对鲤鱼和罗非鱼的麻醉作用. 梁政远,安丽娜,缪凌鸿,徐跑,董在杰. 2009

[19]四个鲤鱼种群遗传多样性的AFLP分析. 钟立强,张成锋,周凯,李冰,王建新,朱健. 2010

[20]鲤鱼(CYPRINUS CARPIO)体细胞系的建立及其生物学特性分析(简报). 孟凡华,尹洪滨,孙中武,陈维多. 2005

作者其他论文 更多>>